Viện Kiểm sát nhân dân huyện Mỹ Đức cũng đã phê chuẩn các Quyết định khởi tố bị can và Lệnh tạm giam của Cơ quan điều tra nêu trên. Công an huyện Mỹ Đức đã chuyển hồ sơ vụ án, các đối tượng và tang vật đến Phòng Cảnh sát hình sự (Công an thành phố Hà Nội) để tiếp tục điều tra làm rõ, xử lý theo quy định.
Trước đó, khoảng 22h ngày 2/2, tại khu vực gần quán karaoke Phương Thủy, thôn Kênh Đào, xã An Mỹ, huyện Mỹ Đức xảy ra vụ đánh nhau xô xát giữa hai nhóm thanh niên. Hậu quả, Lê Văn Hùng - tức “Hai Phệ” (sinh năm 1991 ở thôn Áng Thượng, xã Lê Thanh, huyện Mỹ Đức, Hà Nội) bị thương được đưa đi cấp cứu, nhưng đã tử vong ở Bệnh viện đa khoa Mỹ Đức. Một số đối tượng khác bị thương phải đi điều trị tại Phòng khám đa khoa An Mỹ và cấp cứu tại Bệnh viện đa khoa Vân Đình, huyện Ứng Hòa (Hà Nội).
Ngay sau khi nhận được thông tin, Công an huyện Mỹ Đức đã triển khai lực lượng tiếp cận hiện trường, ngăn chặn hành vi xô xát đánh nhau của hai nhóm đối tượng, đồng thời tổ chức điều tra, truy xét bắt giữ các đối tượng liên quan. Tại hiện trường thu giữ thu giữ 2 dao bầu (loại dao chọc tiết lợn), 5 tuýp có gắn dao phóng, 1 dao dạng kiếm và một số gạch, ngói là phương tiện gây án.
Đến sáng 3/2, Công an huyện Mỹ Đức đã nhanh chóng bắt giữ 5 đối tượng gồm Nguyễn Bá Thương (sinh năm 1997), Nguyễn Văn Tuấn (sinh năm 1986), đều trú tại xã An Mỹ, huyện Mỹ Đức, Hà Nội); Nguyễn Xuân Minh (sinh năm 1999 ở xã Mỹ Thành, huyện Mỹ Đức, Hà Nội); Nguyễn Văn Ngũ (sinh năm 1996 ở xã Hoa Sơn, huyện Ứng Hòa, Hà Nội) và Hoàng Văn Hải (sinh năm 2003 ở xã Nậm Xe, huyện Phong Thổ, tỉnh Lai Châu)
Điều tra mở rộng, cơ quan công an tiếp tục bắt giữ 5 đối tượng liên quan gồm Nguyễn Văn Bắc (sinh năm 1996 ở xã Bột Xuyên, huyện Mỹ Đức, Hà Nội), Bùi Văn Bình (sinh năm 1987), Nguyễn Bá Tình (sinh năm 1979 ở xã An Mỹ, huyện Mỹ Đức, Hà Nội), Lê Văn Lộc, Đoàn Văn Hải (đều sinh năm 1991 và đều trú tại xã Lê Thanh, huyện Mỹ Đức, Hà Nội).
Bước đầu làm rõ, vụ việc xuất phát từ nguyên nhân, Lê Văn Hùng có mâu thuẫn với Nguyễn Bá Phương nên tối mùng 2 Tết, Nguyễn Văn Tuấn và Nguyễn Văn Bắc (bạn của Phương) nắm được thông tin Hùng sẽ có mặt tại địa bàn thôn Cát, xã Tuy Lai, huyện Mỹ Đức, Hà Nội, nên đã gọi Ngũ, Minh, Hải dùng tuýp sắt đánh Hùng gây thương tích.
Sau khi bị đánh, Lê Văn Hùng gọi điện thông báo cho anh trai là Lê Văn Huy và được Huy, Lê Văn Hùng tức "Hai Phệ", Lê Văn Lộc, Đoàn Văn Hải cùng một số đối tượng khác đã kéo đến khu vực quán Karaoke Phương Thuỷ của Nguyễn Bá Phương trả thù cho em. Gặp nhóm của Tuấn và Bắc, nhóm của Huy đã dùng dao (dạng kiếm), tuýp sắt đập vỡ cửa kính xe ô tô, sau đó dùng dao chọc vào xe ô tô gây thương tích cho Bắc, Tuấn, Ngũ, Minh, Hải.
Lúc này Nguyễn Bá Thương (em trai Nguyễn Bá Phương) đi về quán, thấy nhóm của Tuấn và Bắc đang bị vây quanh xe ô tô, liền chạy đến "giải cứu" thì bị nhóm của Huy đánh. Thương gọi điện thoại cho Bùi Văn Bình thông báo về việc bị đánh, Bình gọi điện cho Nguyễn Văn Tình rủ cùng đi, đi đánh nhau với nhóm anh em Huy, Hùng. Hậu quả, Lê Văn Hùng – tức "Hai Phệ" bị Bắc dùng dao bầu đâm vào ngực, dẫn đến tử vong.