Ngày 31/7/2018, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Sơn La ra quyết định khởi tố và cấm đi khỏi nơi cư trú đối với ông Trần Xuân Yến (SN 1971), Phó Giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La, Ủy viên Ban Chỉ đạo thi, Phó Chủ tịch Hội đồng thi, Phó Trưởng Ban chấm thi, Tổ trưởng Tổ chấm thi trắc nghiệm.
Cơ quan công an cũng đã Khởi tố và cấm đi khỏi nơi cư trú đối với Cầm Thị Bun Sọn (SN 1969), Phó Trưởng Phòng Chính trị tư tưởng, Ủy viên Tổ chấm thi trắc nghiệm.
Cũng trong vụ án này, cơ quan công an tỉnh Sơn La đã có quyết định Khởi tố bị can và ra lệnh bắt bị can để tạm giam đối với 03 đối tượng gồm: Nguyễn Thị Hồng Nga (SN 1967), Chuyên viên Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La, Thư ký Ban Chỉ đạo, Ủy viên Tổ chấm thi trắc nghiệm; Đặng Hữu Thủy (SN 1964), Phó Hiệu trưởng Trường Trung học phổ thông Tô Hiệu, Ủy viên Tổ chấm thi trắc nghiệm; và Lò Văn Huynh (SN 1961), Trưởng Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La, Ủy viên Ban Chỉ đạo, Ủy viên Hội đồng thi, Trưởng Ban Thư ký.
Các đối tượng trên đều bị khởi tố về tội danh “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” theo Điều 356 Bộ Luật Hình sự.