Có 880 cơ sở được thanh tra (589 cơ sở có nguồn phóng xạ và 291 cơ sở X-quang). Theo đó, có 84 cơ sở bị xử phạt vi phạm hành chính, chiếm 9,55% (58 cơ sở có nguồn phóng xạ, 26 cơ sở X-quang). Tổng số tiền xử phạt vi phạm hành chính là 552 triệu đồng.
Ngoài xử phạt tiền, cơ quan thanh tra đã áp dụng hình thức xử phạt bổ sung, biện pháp khắc phục hậu quả với các cơ sở vi phạm như buộc khai báo, cấp phép vận chuyển, lưu giữ, sử dụng nguồn phóng xạ; buộc bổ nhiệm người phụ trách an toàn.
Trong năm 2015-2016, toàn quốc đã xảy ra một số vụ mất nguồn phóng xạ do ý thức chấp hành không nghiêm của các tổ chức, cá nhân sử dụng nên Bộ quyết định tiến hành cuộc thanh tra này. Tuy nhiên, 7 tỉnh (Bắc Giang, Hà Nam, Thừa Thiên-Huế, Phú Yên, Quảng Bình, Tuyên Quang và Sơn La) không tổ chức triển khai thanh tra.
Sau thanh tra, Bộ KH&CN sẽ đề xuất sửa đổi văn bản chính sách trong Luật Năng lượng nguyên tử về trách nhiệm đứng đầu tổ chức, cá nhân được cấp phép tiến hành công việc bức xạ; sửa đổi, bổ sung chế tài xử lý vi phạm đối với hành vi báo cáo thực trạng an toàn tiến hành công việc bức xạ định kỳ hàng năm gửi về cơ quan quản lý không trung thực; chỉ đạo cơ quan chức năng hỗ trợ, hướng dẫn diễn tập ứng phó sự cố bức xạ hạt nhân cấp tỉnh…