Theo hồ sơ vụ án, Nguyễn Minh Tuấn và nhân viên cấp dưới đã lợi dụng việc được UBND tỉnh Vĩnh Phúc cấp phép khai thác mỏ đất tại khu đầu Gò Phấng (thôn Cam Lâm, xã Minh Quang, huyện Tam Đảo) đã bán trái phép 75 hóa đơn GTGT ghi khống hàng hóa dịch vụ cho 16 doanh nghiệp trên địa bàn với tổng số tiền thanh toán gần 33 tỷ đồng. Trong đó, tiền thuế GTGT gần 3 tỷ đồng.
Thủ đoạn của Tuấn và cấp dưới là lập, ký, đóng dấu khống hợp đồng kinh tế, bảng báo giá, biên bản đối chiếu khối lượng, biên bản nghiệm thu…
Để che giấu hành vi mua bán trái phép hóa đơn và thực hiện quy định giao dịch thanh toán từ 20 triệu đồng trở lên phải chuyển khoản qua ngân hàng, Tuấn yêu cầu doanh nghiệp mua hóa đơn chuyển tiền sang tài khoản công ty. Sau đó, Tuấn ký séc rút tiền giao cho bộ phận kế toán đến ngân hàng rút số tiền doanh nghiệp mua hóa đơn chuyển vào tài khoản của công ty rồi đưa cho Tuấn để trả lại doanh nghiệp mua hóa đơn.
Cơ quan chức năng xác định các đối tượng thu từ 8,5% - 13,5% giá trị hàng hóa mua trên hóa đơn, thu về số tiền hơn 4,4 tỷ đồng từ việc bán trái phép hóa đơn.