Hơn 10 năm vận hành, NSW đã có nhiều đóng góp quan trọng với cơ quan quản lý và cộng đồng DN. Đối với Chính phủ, việc triển khai Cổng thông tin một cửa quốc gia đã phục vụ tiếp nhận thông tin khai báo của DN; xử lý và trao đổi thông tin với hệ thống chuyên ngành của các Bộ, ngành và kết nối với Cơ chế một cửa ASEAN, qua đó tạo điều kiện thuận lợi thông thương hàng hóa và hình ảnh, vị thế, vai trò của Việt Nam tham gia vào chuỗi cung ứng của thế giới...
Đối với các Bộ, ngành và các bên liên quan, NSW cơ bản đáp ứng yêu cầu mở rộng kết nối và triển khai nhanh các thủ tục hành chính; phần nào đáp ứng được yêu cầu cấp bách của việc kết nối hệ thống chuyên ngành của các Bộ, ngành với Cổng thông tin một cửa quốc gia...
Đối với người dân, DN, NSW đã góp phần đơn giản hóa TTHC, giảm thời gian thực hiện thủ tục như cấp phép, kiểm tra chuyên ngành của các Bộ, ngành liên quan tới hoạt động thương mại xuyên biên giới.
Dù đạt được nhiều kết quả tích cực, nhưng qua hơn 10 năm triển khai, NSW đã bộc lộ những tồn tại, hạn chế.
Để khắc phục các hạn chế, tồn tại và nâng cao hơn nữa hiệu quả thực hiện NSW trong bối cảnh quy mô thương mại của Việt Nam ngày càng tăng cao, Cục Hải quan kiến nghị cơ quan có thẩm quyền sửa đổi Nghị định số 85/2019/NĐ-CP quy định thực hiện TTHC theo NSW, Cơ chế một cửa ASEAN và kiểm tra chuyên ngành đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu.
Việc sửa Nghị định 85 theo hướng ban hành một quy trình chung, bộ tiêu chuẩn kỹ thuật và mẫu dữ liệu chung trong khai báo thực hiện TTHC cấp phép, kiểm tra chất lượng và các thủ tục khác có liên quan đến quản lý nhà nước đối với hàng hóa xuất nhập khẩu, quá cảnh của tất cả Bộ, ngành để thực hiện đồng bộ, thống nhất; bảo đảm tính chuẩn hóa, khả năng liên kết và chia sẻ dữ liệu; nâng cao mức độ tự động hóa của hệ thống; tạo cơ hội ứng dụng công nghệ mới. Cục cũng kiến nghị Bộ Tài chính bố trí đủ nguồn vốn để hoàn thành nhiệm vụ triển khai các nội dung gắn với NSW bao gồm: Mở rộng giai đoạn 3 theo chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ; kết nối và trao đổi C/O điện tử với Hàn Quốc; thuê dịch vụ hỗ trợ quản trị, vận hành; thay thế các máy chủ và trang thiết bị đã hết khấu hao; đầu tư hệ thống dự phòng...
