Xác định nhiệm vụ cải cách hành chính là trọng tâm, hằng năm, Sở Khoa học và Công nghệ Vĩnh Phúc đều xây dựng kế hoạch cải cách hành chính, giao nhiệm vụ, trách nhiệm cụ thể cho từng phòng, đơn vị trực thuộc. Về cải cách thể chế: đã kịp thời tham mưu Tỉnh ủy, HĐND, UBND tỉnh ban hành: Nghị quyết số 10/2023/NQ-HĐND ngày 20/7/2023 của HĐND tỉnh về Quy định mức hỗ trợ đăng ký bảo hộ tài sản trí tuệ trên địa bàn tỉnh Vĩnh Phúc đến năm 2030; Quyết định số 669/QĐ-UBND ngày 27/3/2023 của UBND tỉnh ban hành Kế hoạch thực hiện Chỉ thị số 36- CT/TU ngày 29/12/2022 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy về tăng cường công tác lãnh đạo của Đảng về phát triển khoa học công nghệ và đổi mới sáng tạo trên địa bàn tỉnh đến năm 2030; Quyết định số 07/2023/QĐ-UBND ngày 04/4/2023 của UBND tỉnh v/v sửa đổi, bổ sung Khoản 10 Điều 1 Quyết định số 62/2021/QĐUBND ngày 02/12/2021 của UBND tỉnh Vĩnh Phúc Sửa đổi một số điều của Quy định Quản lý các nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách Nhà nước cấp tỉnh và cấp cơ sở trên địa bàn tỉnh Vĩnh Phúc ban hành kèm theo Quyết định số 47/2019/QĐ -UBND ngày 10/10/2019 của UBND tỉnh Vĩnh Phúc; Quyết định số 843/QĐ-UBND ngày 18/4/2023 của UBND tỉnh ban hành Kế hoạch thực hiện Chiến lược phát triển khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo đến năm 2030 trên địa bàn tỉnh Vĩnh Phúc.
Bên cạnh đó, Sở Khoa học và Công nghệ Vĩnh Phúc đã tham mưu UBND tỉnh ban hành: Quyết định số 421/QĐ-CT ngày 27/02/2023 về việc công bố Danh mục thủ tục hành chính được tích hợp, cung cấp dịch vụ công trực tuyến toàn trình, dịch vụ công trực tuyến một phần thuộc phạm vi quản lý nhà nước của Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Vĩnh Phúc; Quyết định số 1875/QĐ-CT ngày 23/8/2023 về việc công bố thủ tục hành chính mới ban hành lĩnh vực Sở hữu trí tuệ thuộc thẩm quyền giải quyết của Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Vĩnh Phúc; Quyết định số 1876/QĐ-CT ngày 23/8/2023 về việc công bố danh mục thủ tục hành chính bị bãi bỏ lĩnh vực hoạt động khoa học và công nghệ thuộc thẩm quyền giải quyết của Sở khoa học và Công nghệ tỉnh Vĩnh Phúc; Quyết định số 2464/QĐ-CT ngày 14/11/2023 về việc công bố thủ tục hành chính mới ban hành, được sửa đổi, bổ sung, bị bãi bỏ trong lĩnh vực Hoạt động khoa học và công nghệ thuộc thẩm quyền giải quyết của Sở Khoa học và Công nghệ; Quyết định số 2472/QĐ-CT ngày 15/11/2023 Về việc công bố thủ tục hành chính được sửa đổi, bổ sung trong lĩnh vực Năng lượng nguyên tử, an toàn bức xạ và hạt nhân thuộc thẩm quyền giải quyết của Sở Khoa học và Công nghệ. Sở Khoa học và Công nghệ hiện có có 57 dịch vụ công trực tuyến, trong đó có 08 TTHC mức độ 2; 27 dịch vụ công trực tuyến mức độ 3 và 22 dịch vụ công trực tuyến mức độ 4; được công bố kịp thời và đăng tải công khai đầy đủ chi tiết trên trang thông tin điện tử của Sở tại địa chỉ: sokhcn.vinhphuc.gov.vn. Tính đến hết ngày 30/11/2023, tổng số hồ sơ tiếp nhận và giải quyết TTHC tại Trung tâm hành chính công, cụ thể: tổng số hồ sơ tiếp nhận trực tuyến là 458 hồ sơ trên tổng số 459 hồ sơ của dịch vụ công trực tuyến mức độ 3, mức độ 4 (bao gồm cả tiếp nhận trực tiếp và trực tuyến), đạt 99,78%. Sở đã thực hiện 35 giao dịch thanh toán trực tuyến trên tổng số 89 giao dịch (bao gồm cả tiếp nhận trực tiếp và trực tuyến), đạt 39,33%. Song song với đó, trong năm 2023, tiếp tục, rà soát, sắp xếp, tinh gọn bộ máy theo Nghị định số 107/2020/NĐ-CP ngày 14 tháng 9 năm 2020 của Chính phủ sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định số 24/2014/NĐ-CP ngày 04 tháng 04 năm 2014 của Chính phủ quy định tổ chức các cơ quan chuyên môn thuộc Uỷ ban nhân dân tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; Quyết định số 47/2021/QĐ-UBND ngày 23/8/2021 của UBND tỉnh Vĩnh Phúc quy định vị trí, chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Vĩnh Phúc, sau khi sắp xếp kiện toàn đã giảm 3 phòng chuyên môn thuộc Sở và 1 đơn vị trực thuộc Sở.
Tuy nhiên bên cạnh những kết quả đạt được, công tác cải cách hành chính tại Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Vĩnh Phúc còn gặp một số khó khăn, các nội dung CCHC chưa được tiến hành đồng bộ. Tổ chức các phòng, ban được tổ chức và thu gọn về đầu mối và rõ ràng về chức năng, nhiệm vụ nhưng nội bộ một số cơ phòng, đơn vị chuyên môn chưa thật gọn nhẹ, một số lĩnh vực chưa phân định rõ trách nhiệm hoặc còn chồng chéo trong quản lý; Vấn đề phân công, phân cấp trong một số lĩnh vực quản lý hành chính còn chưa thật rõ ràng, gây trở ngại khi giải quyết thủ tục hành chính liên quan đến công việc của các công dân và tổ chức; Cơ sở vật chất của bộ phận một cửa chưa được hoàn thiện nên chưa đáp ứng với nhu cầu hiện tại của nhiệm vụ công việc phải thực hiện, địa điểm làm việc của một số phòng, ban không tập trung, gây khó khăn trong việc giải quyết các công việc có liên quan; Việc tổ chức chỉ đạo thực hiện CCHC ở một số đơn chưa thực sự chủ động, chưa xây dựng được Kế hoạch CCHC theo giai đoạn; công tác xây dựng, ban hành văn bản tại một số đơn vị chưa đúng về nội dung và thể thức văn bản; Việc tăng cường kiểm tra rà soát và thẩm định đối với văn bản của các phòng ban chưa được tiến hành thường xuyên, hiệu quả áp dụng hệ thống quản lý theo tiêu chuẩn ISO 9001: 2000 vào hoạt động chưa thực sát với khả năng của đội ngũ cán bộ và công việc cần giải quyết.
