Theo Reuters, vụ đánh bom đầu tiên xảy ra tại nhà thờ Công giáo St Mary. CNN dẫn lời Tổng thanh tra cảnh sát Indonesia Machfud Arifin cho biết, kẻ đánh bom liều chết đã sử dụng một chiếc xe máy khi gây án. Theo lời một nhân chứng, khối thuốc nổ đã được đặt trong một chiếc thùng các-tông. Tiếp sau đó, một khối bom cũng đã phát nổ ở khu đỗ xe ở nhà thờ Pentacostal. Vụ nổ thứ 3 xảy ra tại Nhà thờ công giáo Indonesia. Mỗi vụ việc xảy ra cách nhau 10 phút và vụ đánh bom đầu tiên xảy ra vào lúc 7h30 (giờ địa phương).
Theo người phát ngôn cảnh sát tỉnh Đông Java Frans Barung Mangera, ngoài các vụ nổ đã xảy ra ở 3 nhà thờ, một khối thuốc nổ không phát nổ cũng đã được tìm thấy ở một địa điểm khác tại tỉnh. Ngoài 11 người đã thiệt mạng, 40 người còn lại bị thương trong các vụ việc đã được đưa tới bệnh viện cấp cứu, trong đó có những người bị thương nặng. Do đó, con số tử vong trong vụ việc được dự báo có thể còn tiếp tục tăng lên.
Ngay sau vụ việc, giới chức Indonesia đã thắt chặt an ninh tại tất cả những địa điểm mà người dân có thể tụ tập. Đến chiều ngày 13/5 vẫn chưa có nhóm nào đứng ra nhận trách nhiệm về vụ tấn công. Song, ông Wawan Purwanto – Giám đốc truyền thông tại cơ quan tình báo Indonesia – cho biết, các thông tin thu thập được cho thấy nhóm Jemaah Ansharut Daulah (JAD) có quan điểm ủng hộ IS được cho là thủ phạm đứng sau các vụ đánh bom vừa xảy ra. JAD là tổ chức đã bị Bộ Ngoại giao Mỹ xếp vào danh sách các tổ chức khủng bố. Nhóm này đã thu hút được hàng trăm đối tượng có quan điểm ủng hộ IS ở Indonesia.
Là nước có đông người Hồi giáo nhất thế giới, tại Indonesia thời gian qua đã xảy ra nhiều vụ tấn công do những phần tử cực đoan gây ra. Các hoạt động của các nhóm Hồi giáo ở nước này đã gia tăng gần đây, cùng với sự trỗi dậy của nhóm IS. Vụ tấn công nghiêm trọng gần đây nhất xảy ra vào tháng 1/2016, khi 4 kẻ đánh bom liều chết và những tay súng đã tấn công một trung tâm thương mại ở trung tâm Jakarta.
Bộ trưởng Ngoại giao Indonesia Retno Masudi đã lên án vụ tấn công mới nhất. “Chúng tôi sẽ không lùi bước trong cuộc chiến chống lại chủ nghĩa khủng bố”, Ngoại trưởng Marsudi tuyên bố. Một người phát ngôn của Hiệp hội các nhà thờ Indonesia cũng đã lên tiếng kêu gọi chính phủ giúp tăng cường an ninh tại các nhà thờ ở nước này.