Thông tin từ Bộ Công an, Cục Quản lý xuất nhập cảnh, Bộ Công an, cơ quan chức năng đưa Phạm Minh Hoàng trở về Pháp trên chuyến bay số hiệu VN11M của Hãng hàng không Vietnam Airlines, khởi hành lúc 22h55 ngày 24/6 từ sân bay quốc tế Tân Sơn Nhất; đến 11h30 ngày 25/6 (tức 6h30 ngày 25/6, theo giờ địa phương tại Pháp) Phạm Minh Hoàng đã trở về Pháp an toàn.
Ngày 17/5/2017, Chủ tịch nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam đã ra Quyết định số 832/QĐ-CTN về việc tước quốc tịch Việt Nam đối với Phạm Minh Hoàng do vi phạm pháp luật Việt Nam.
Sau khi bị tước quốc tịch Việt Nam thì việc cư trú của Hoàng tại Việt Nam là bất hợp pháp. Ngày 23/6/2017, Cục Quản lý xuất nhập cảnh – Bộ Công an Việt Nam đã ra Quyết định trục xuất Phạm Minh Hoàng theo đúng thủ tục hành chính.
Ngày 24/6/2017, Tổng Lãnh sự quán Pháp tại TP HCM đã cấp giấy thông hành cho Phạm Minh Hoàng để trở về Pháp với tư cách là công dân Pháp.