Mỗi người dân có một mã định danh y tế (ID) duy nhất và tồn tại suốt đời. Mã định danh y tế quốc gia được sinh tự động từ hệ thống mã định danh của Bộ Y tế.
Mã định danh y tế gồm dãy các ký tự, được chia thành 3 phần gồm số bảo hiểm xã hội (BHXH) của cá nhân tham gia BHXH; ký tự dùng để xử lý các công nghệ không có định hướng; ký tự sử dụng để đảm bảo định danh hợp lệ (những ký tự này được sinh ra theo một thuật toán cố định dựa trên những thông tin cơ bản như: số BHXH, họ và tên, năm sinh, giới tính, nơi sinh).
Trên cơ sở mã số BHXH và thông tin hành chính của người dân, hệ thống mã định danh y tế của Bộ Y tế sẽ tự động xác lập ID của người dân.
Mã định danh y tế được lưu trữ, quản lý tại hệ thống mã định danh y tế quốc gia đặt tại trung tâm dữ liệu y tế thuộc Cục Công nghệ thông tin – Bộ Y tế. Các cơ sở y tế có trách nhiệm quản lý ID được cấp. Hệ thống mã định danh y tế quốc gia định kỳ đồng bộ dữ liệu với cơ sở dữ liệu hộ gia đình tham gia BHXH của BHXH Việt Nam.
