Để bảo đảm phù hợp với khả năng thực hiện và giải ngân của nguồn vốn, Tổng công ty VNR đã xem xét nghiên cứu lựa chọn cải tạo, nâng cấp 4 công trình thiết yếu tuyến đường sắt Hà Nội – TP HCM trong giai đoạn 2017-2020.
Cụ thể, 4 dự án là: Cải tạo, nâng cấp các công trình thiết yếu đoạn Hà Nội - Vinh tổng mức đầu tư dự kiến 1.600 tỷ đồng; đoạn Nha Trang – TP HCM tổng mức đầu tư 1.800 tỷ đồng; cải tạo, nâng cấp các hầm yếu và các công trình thiết yếu đoạn Vinh - Nha Trang tổng mức đầu tư 1.800 tỷ đồng; và cải tạo, nâng cấp các cầu yếu và gia cố trụ chống va xô trên tuyến đường sắt Hà Nội – TP HCM tổng mức đầu tư 1.800 tỷ đồng.
Bên cạnh đó, VNR cũng tính toán phải xây dựng 42km hàng rào, đường gom để đóng các lối đi dân sinh bảo đảm an toàn giao thông; cải tạo mái che ke ga tại 13 ga có lưu lượng hành khách đi tàu lớn.