Theo chuyên gia giao thông, khi vận hành thử toàn hệ thống sẽ gồm toàn bộ các hạng mục như: tần suất chạy tàu, vận hành tại nhà ga, Depot...; trong đó, các đoàn tàu phải đạt tần suất 2 phút lại có một đoàn tàu cập nhà ga theo thiết kế dự án.
Đại diện Công ty TNHH MTV Đường sắt Hà Nội, đơn vị tiếp nhận khai thác dự án đường sắt Cát Linh - Hà Đông cũng cho biết, nhân sự của đơn vị này cũng đang được chuyên gia đào tạo thực hành, hướng dẫn chuyển giao kỹ thuật, công nghệ khai thác theo chương trình của dự án. Đến nay, chưa có kế hoạch về vận hành thử toàn hệ thống.