Tại CHKQT Vân Đồn, hàng rào an ninh ngăn cách khu vực hạn chế, hàng rào ranh giới cảng hàng không bị đổ; một số tấm kính lớp trang trí bên ngoài Nhà ga hành khách bị rơi vỡ; mái kính bên ngoài nhà ga phía cầu cạn bị rơi vỡ.
Tại khu vực Nhà ga quốc tế của Cảng, lượng nước mưa tạt vào lớn khiến khu cách ly quốc tế tràn nước xuống các phòng thiết bị; hàng rào bao quanh Đài bị nghiêng và 01 đoạn tiếp giáp sân đỗ máy bay bị đổ.
Tại CHKQT Cát Bi, cây tại khu vực nhà ga cũ bị đổ; một số tấm trần của nhà ga hàng hoá (nhà ga cũ) và phần bên nhà ga quốc tế bị bung ở phía trong; cửa kính của sảnh đến quốc tế bị vỡ, mạng viễn thông bị gián đoạn liên tục.
Tại CHKQT Nội Bài đã tạm dừng tiếp nhận tàu bay đến 24h00 ngày 07/9/2024. Trang thiết bị phương tiện mặt đất hoạt động bình thường, đảm bảo an toàn.
Tại CHK Điện Biên, Thọ Xuân, Vinh, Đồng Hới, các trang thiết bị hàng không hoạt động bình thường; các chuyến bay thực hiện đúng theo kế hoạch.
Số chuyến bay bị hủy bởi cơn bão Yagi tổng cộng khoảng 120 chuyến bay (khoảng 103 chuyến bay nội địa và 17 chuyến bay quốc tế).
Cục HKVN đã chỉ đạo phòng chức năng xem xét cấp phép bay bổ sung cho các Hãng hàng không từ ngày 08/9/2024 để bảo đảm đáp ứng nhu cầu đi lại của hành khách sau bão.