Các tham luận tại Hội thảo tập trung đến vấn đề tác động của hoạt động du lịch đối với môi trường, cảnh quan trong các hệ thống hang động tại VQG Phong Nha – Kẻ Bàng; sự xáo trộn môi trường Karst (hiện tượng phong hóa đặc trưng của những miền núi đá vôi bị nước chảy xói mòn) VQG Phong Nha – Kẻ Bàng và đề xuất giải pháp quản lý tài nguyên Karst; đa dạng sinh học hang động tại VQG Phong Nha – Kẻ Bàng; hệ thực vật đèn trong hang động tại VQG Phong Nha – Kẻ Bàng và phương án xử lý; sự biến đổi môi trường và thành tạo trong hang động…
Nhiều đại biểu có cùng quan điểm lo ngại rằng, nguồn thu sẽ tăng vọt nhờ đẩy mạnh du lịch nhưng đến một lúc nào đó chúng ta sẽ phải bỏ ra những số tiền lớn hơn nhiều lần nguồn thu ấy để phục hồi cho tự nhiên hang động.
Việc cân bằng hài hòa giữa phát triển du lịch hang động và bảo tồn di sản vẫn đang là bài toán khó.