Tính từ đầu năm đến hết tháng 11, toàn ngành đã thực hiện kiểm tra sau thông quan 8.311 cuộc, trong đó có 1.227 cuộc kiểm tra tại trụ sở người khai hải quan (bằng 101% so với cùng kỳ năm 2015), đạt 86% chỉ tiêu được giao. Qua kiểm tra, cơ quan Hải quan ra quyết định truy thu 3.388 tỷ đồng, đến nay các doanh nghiệp đã nộp ngân sách 2.084 tỷ đồng (tăng 30% so cùng kỳ năm 2015), đạt 74,4% chỉ tiêu được giao (chỉ tiêu 2.800 tỷ đồng).
Điểm đáng chú ý trong công tác kiểm tra sau thông quan gần đây là việc cơ quan Hải quan tập trung vào kiểm tra những doanh nghiệp, lô hàng có dấu hiệu rủi ro cao. Cụ thể, tổng hợp kết quả kiểm tra tại các Cục Hải quan địa phương lớn, đánh giá hiệu quả công tác kiểm tra sau thông quan về trị giá hải quan đối với các tờ khai trong thời hạn 60 ngày tại các Cục Hải quan địa phương lớn để chỉ đạo tăng cường công tác kiểm tra trị giá, rà soát, sửa đổi danh mục rủi ro về giá.
Đặc biệt, lực lượng kiểm tra sau thông qua đã triển khai công tác kiểm tra sau thông quan đối với hoạt động nhập khẩu và mua bán xe ô tô Range rover, Jaguar, Mercedes; tổng hợp kết quả các cuộc kiểm tra, thanh tra, kiểm tra sau thông quan đối với mặt hàng ô tô chở người nhập khẩu loại từ 9 chỗ ngồi trở xuống theo chỉ đạo của Bộ Tài chính; ban hành danh sách doanh nghiệp trọng điểm kiểm tra sau thông quan, đảm bảo việc kiểm tra thống nhất, hiệu quả, tránh chồng chéo giữa Tổng cục Hải quan và Cục Hải quan các địa phương...