Với chức năng đào tạo, nghiên cứu khoa học; sản xuất và lưu trữ chế phẩm máu, mỗi năm Trung tâm tổ chức từ 22 đến 25 đợt hiến máu tình nguyện, thu được khoảng 10.000 đơn vị máu, điều chế sản xuất khối hồng cầu, khối tiểu cầu, huyết tương tươi, huyết tương đông lạnh phục vụ công tác điều trị kịp thời và an toàn. Bảo đảm cung cấp đủ máu cho 5 bệnh viện quân đội theo yêu cầu của Bộ Quốc phòng.
Trong sự thành công chung của Bệnh viện Quân y 103, Học viện Quân y về lĩnh vực ghép tạng, có phần đóng góp của Bộ môn - Trung tâm HHTM. Kể từ năm 1992, thời điểm ca ghép thận đầu tiên tại Việt Nam được tiến hành thành công tại Bệnh viện Quân y 103, cùng với các Trung tâm, Bộ môn - Khoa trong Bệnh viện, Trung tâm HHTM đã tham gia thực hiện thành công trên 480 ca ghép thận, 2 ca ghép gan (từ năm 2004), 2 ca ghép tim (từ năm 2010), 1 ca ghép đa tạng đồng thời tụy - thận (năm 2014), 1 ca ghép phổi từ người sống đầu tiên tại Việt Nam (năm 2017).
Với thành tựu là cơ sở đầu tiên tại Việt Nam thực hiện thành công các kỹ thuật cao về ghép thận, ghép gan, ghép tim, ghép đa tạng tụy - thận và ghép phổi, Bệnh viện Quân y 103 đã được vinh danh đạt kỷ lục Guiness Việt Nam.
