Theo cáo trạng, khoảng 15h ngày 2/5/2011, Thông lúc này đã uống rượu ngà ngà say, đến nhà một người bạn chơi nhưng anh này đi vắng, chỉ có ba cháu bé con của bạn ở nhà.
Thấy vậy, Thông gọi cháu gái lớn nhất (SN 2000) tới giả vờ bắt chấy ở hiên nhà. Nhân lúc hai cháu nhỏ xem ti vi phía trong nhà, Thông đã giở trò đồi bại với cháu bé này.
Ngày 16/5/2011, cha cháu bé biết chuyện và tố cáo nên Thông bỏ trốn. Ngày 15/9/2011, Thông về lại địa phương và được cơ quan điều tra triệu tập tới làm việc, sau đó Thông lại bỏ trốn, đến ngày 12/7/2013 thì bị bắt theo lệnh truy nã.
Sáng 21/4, TAND tỉnh Khánh Hòa đã mở phiên tòa xét xử sơ thẩm và tuyên phạt bị cáo Nguyễn Duy Thông (SN 1974, trú tại thị xã Ninh Hòa, tỉnh Khánh Hòa) 12 năm tù về tội “Hiếp dâm trẻ em”. Ngoài ra, bị cáo còn bị buộc phải bồi thường cho đại diện hợp pháp của người bị hại 20 triệu đồng.
