Sau 44 ngày địa ngục, ngày 4/1/1989, Furuta đã trút hơi thở cuối cùng trong tình trạng dung mạo bị hủy hoại nặng nề bởi những vết bỏng, nội tạng và não bộ bị tổn thương cực độ sau những màn đánh đập thú tính.
Trong số 7 kẻ thủ ác, 4 kẻ bị bắt gồm: Hiroshi Yokoyama, Jo Kamisaku, Nobuharu Minato, Yasushi Watanabe. Ba nghi can khác thoát tội là Koichi Ihara, Tetsuo Nakamura cùng một tên không rõ danh tính. Trước đó, cảnh sát đã tìm thấy tinh dịch của 3 nghi can này trong thi thể Junko nhưng chi tiết này không đủ yếu tố cấu thành tội giết người nên chúng đã thoát tội.
Tháng 7 năm 1991, tòa án đã tuyên án bị cáo Hiroshi 20 năm tù giam; Kamisaku 5 đến 9 năm; hai tên còn lại từ 5 đến 7 năm tù giam. Bản án này là một sự xúc phạm đối với gia đình Junko Furuta cũng như dư luận Nhật Bản. Bố mẹ của Furuta quyết tâm đòi quyền công bằng bằng một vụ kiện dân sự khác nhằm chống lại các bị cáo cũng như phụ huynh của chúng vì đã không ngăn cản sự việc khủng khiếp xảy ra trong khi biết rất rõ. Rốt cuộc, gia đình bị cáo (chủ sở hữu ngôi nhà xảy ra vụ án) đã phải bán căn nhà đi và bồi thường cho gia đình bị hại 50.000 yên (tương đương 600.000 USD).
Vụ án Junko Furuta chính thức khép lại nhưng dư âm của nó vẫn còn gây xôn xao dư luận Nhật Bản, không chỉ bởi bản án có phần khoan nhượng với các bị cáo mà còn bởi thực tế là trong số 7 kẻ thủ ác vẫn còn 3 kẻ lọt khỏi lưới pháp luật. Nhiều người bắt đầu hoài nghi về chính sách khoan nhượng của hệ thống tư pháp và chất lượng giáo dưỡng của những trung tâm phục hồi nhân phẩm cho tội phạm vị thành niên.
Điển hình là bị cáo Hiroshi Yokoyama trước khi gây ra vụ án Junko Furuta thường giao du với dân xã hội đen Nhật Bản. Y cũng đã từng phải vào trại cải tạo tội phạm vị thành niên một thời gian trước khi được trả tự. Tuy nhiên, rõ ràng là hệ thống phục hồi nhân phẩm của Nhật Bản đã thất bại trong việc giúp Hiroshi trở thành người lương thiện vì sau đó y vẫn “ngựa quen đường cũ”, tiếp tục gây rối an ninh trật tự. Đỉnh điểm của tội ác là việc Hiroshi cầm đầu nhóm 7 người cưỡng bức, tra tấn dẫn đến cái chết của nữ sinh Junko Furuta.
Câu chuyện bi thảm về số phận của nữ sinh Junko Furuta trở thành nguồn cảm hứng cho nhiều loại hình nghệ thuật, từ sách, tiểu thuyết, hội họa, truyện tranh cho đến điện ảnh, âm nhạc… Lý do khiến câu chuyện này trở thành nguồn cảm hứng cho giới nghệ thuật một phần là vì sự bí ẩn không có lời giải mà nó chứa đựng.
Điều đặc biệt kỳ lạ về vụ án này là sự thiếu vắng những nguồn tin chính thống, bất chấp sự vào cuộc gắt gao của giới truyền thông Nhật Bản thời bấy giờ, cứ như thể toàn bộ thông tin về vụ án đã bị một thế lực nào đó che giấu. Điều duy nhất mà người ta có thể khẳng định chắc chắn là những gì nạn nhân Junko Furuta đã trải qua trong 44 ngày thực sự ghê rợn như báo chí đã mô tả.
Hiện tại, cả 4 bị cáo đều đã mãn hạn tù và được trả tự do. Thay tên, đổi họ sau khi ra tù, những kẻ phạm tội ác ghê rợn năm nào nghiễm nhiên trở thành những con người lương thiện, trừ một người – Jo Kamisaku.
Jo Kamisaku bị xét xử là kẻ đồng lõa chính với chủ mưu Hiroshi trong vụ án Junko Furuta nhưng rốt cuộc hắn lại lãnh bản án nhẹ nhất: 8 năm tù giam. Thời điểm gây án, Kamisaku mới 17 tuổi và hắn hoàn tất bản án của mình ngay trước sinh nhật lần thứ 25. Khi ra tù, Kamisaku đổi tên và được nhận vào làm tại một công ty công nghệ. Nhờ danh tính mới, Kamisaku đã lặng lẽ hòa nhập trở lại xã hội.
Thế nhưng, trong vòng 5 năm sau đó, Kamisaku lại quay trở lại với thế giới ngầm Tokyo và gặp rắc rối với luật pháp. Năm 27 tuổi, Kamisaku bị bắt vì tội hành hung một người quen tên là Takatoshi Isono vì ghen tuông. Kamisaku theo dõi Isono, đe dọa, đánh đập và nhốt nạn nhân vào cốp xe rồi đưa anh ta từ Adachi tới Misato, sau đó tiếp tục hành hung, tra tấn nạn nhân suốt 4 tiếng. Kamisaku còn dọa giết và phi tang xác nạn nhân.
Giống như bị cáo Hiroshi, rõ ràng Kamisaku hoàn toàn không hối hận về hành vi phạm tội trước đây của y. Trong suốt phiên tòa xét xử vụ hành hung Isono, Kamisaku phủ nhận mọi cáo buộc hành hung, đe dọa cũng như dọa giết nạn nhân. Tuy nhiên, cuối cùng Kamisaku vẫn phải lãnh 7 năm tù. Đến nay, bản án này đã kết thúc và không ai biết sau khi ra tù Kamisaku đang lưu lạc nơi nào.
