Học sinh đăng ký vào lớp 10 chuyên thi trong 2 ngày: Ngày 8/6/2016, buổi sáng thi môn Ngữ Văn, buổi chiều thi môn Toán; sáng 9/6/2016 thi môn Ngoại ngữ không chuyên; chiều 9/6/2016 và sáng 10/6/2016 thi các môn chuyên theo lịch.
Môn Ngoại ngữ thi sáng ngày 9/6/2016: Học sinh sẽ thi bằng ngoại ngữ đã được học ở cấp THCS, thi theo hình thức trắc nghiệm và tự luận.
Học sinh dự tuyển vào lớp chuyên Tiếng Pháp (của Trường THPT chuyên Nguyễn Huệ), chuyên Tiếng Nga, chuyên Tiếng Trung sẽ làm bài thi môn chuyên bằng môn Ngoại ngữ đã được học ở cấp THCS.
Trường hợp học sinh dự thi vào lớp chuyên Tiếng Pháp của Trường THPT Nguyễn Huệ: Nếu thi bằng Tiếng Anh thay thế, sẽ thi cùng đề với học sinh thi chuyên Tiếng Anh (sáng 10/6/2016) và không được đăng ký thi các môn chuyên khác có lịch thi chiều ngày 9/6/2016.
Nội dung thi dựa theo yêu cầu chuẩn kiến thức, kỹ năng của chương trình giáo dục cấp THCS hiện hành, chủ yếu thuộc chương trình lớp 9.
Các môn thi theo hình thức tự luận, riêng môn Ngoại ngữ sẽ được kết hợp giữa hình thức tự luận và trắc nghiệm.