Thực hiện Quyết định số 2706/QĐ-BQP ngày 29/6/2019 của Bộ Quốc phòng triển khai Quyết định số 15/2019/QĐ-TTg ngày 28/3/2019 của Thủ tướng Chính phủ về việc thực hiện thủ tục biên phòng điện tử tại các cửa khẩu do Bộ Quốc phòng quản lý, đến nay, Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng đã xây dựng, triển khai dự án thực hiện thủ tục biên phòng điện tử tại các cửa khẩu do Bộ Quốc phòng quản lý; tập trung triển khai thực hiện giai đoạn 1 tại 5 cửa khẩu quốc tế biên giới trên đất liền theo Quyết định số 15/2019/QĐ-TTg, tổ chức tập huấn, hướng dẫn cho cán bộ, nhân viên tại các cửa khẩu có đủ trình độ, năng lực đáp ứng yêu cầu thực hiện thủ tục biên phòng điện tử...
Quyết định số 15/2019/QĐ-TTg quy định thủ tục biên phòng điện tử cửa khẩu biên giới đất liền được thực hiện 24/24 giờ hàng ngày, kể cả ngày nghỉ, ngày lễ.
Đối tượng thực hiện thủ tục biên phòng điện tử gồm người, người điều khiển, người đi trên phương tiện, phương tiện xuất cảnh, nhập cảnh tại cửa khẩu quốc tế, cửa khẩu chính trên biên giới đất liền; tàu biển Việt Nam hoạt động tuyến nội địa đến và rời cửa khẩu cảng. Việc cấp thị thực tại các cửa khẩu quốc tế biên giới đất liền và cửa khẩu cảng do Bộ Quốc phòng quản lý.
Người làm thủ tục khai báo hồ sơ biên phòng điện tử và nhận xác nhận hoàn thành khai báo thủ tục biên phòng điện tử cửa khẩu biên giới đất liền bằng tài khoản đã được cấp tại bất kỳ nơi nào có thể truy cập internet. Biên phòng cửa khẩu biên giới đất liền thực hiện thủ tục biên phòng điện tử tại Nhà kiểm soát liên hợp cửa khẩu quốc tế, cửa khẩu chính.
Trong thời gian Cổng thông tin thủ tục biên phòng điện tử chưa hoàn thiện kết nối với Cổng thông tin một cửa quốc gia để thực hiện thủ tục biên phòng điện tử hoặc trường hợp Cổng thông tin một cửa quốc gia có sự cố, Biên phòng cửa khẩu biên giới đất liền và người làm thủ tục thực hiện thủ tục biên phòng điện tử cửa khẩu biên giới đất liền qua Cổng thông tin thủ tục biên phòng điện tử theo quy định tại Quyết định số 2706/QĐ-BQP.
Việc thực hiện thủ tục biên phòng điện tử gồm hai giai đoạn: giai đoạn 1 kể từ ngày 1/6/2019 đến hết năm 2019 tại các cửa khẩu quốc tế: Móng Cái (Quảng Ninh), Hữu Nghị (Lạng Sơn), Cầu Treo (Hà Tĩnh), Cha Lo (Quảng Bình), Mộc Bài (Tây Ninh). Giai đoạn 2 từ năm 2020 và các năm tiếp theo, thực hiện tại các cửa khẩu quốc tế còn lại và các cửa khẩu chính trên biên giới đất liền.