Theo cáo trạng, Tuấn làm Giám đốc NHNN Chi nhánh Đồng Nai từ 2014 - 2017. Ngày 10/2/2014, cơ quan này ban hành kế hoạch thanh tra Quỹ tín dụng (QTD) Tân Tiến nhưng Tuấn không cho thanh tra theo kế hoạch mà điều chỉnh thanh tra sang 2015.
Từ 2015 và 2016, các báo cáo giám sát chỉ ra dấu hiệu mất an toàn của QTD Tân Tiến nhưng Tuấn vẫn không cho thực hiện thanh tra.
Đến tháng 4/2017, Tuấn chỉ đạo Hiển và ông Lê Xuân Hưởng (Phó Chánh Thanh tra, giám sát) đến làm việc, nắm tình hình. Khi biết đơn vị này có nhiều sai phạm, Tuấn vẫn chỉ đạo không thanh tra mà ký văn bản đóng dấu "mật" yêu cầu chấn chỉnh, khắc phục các sai phạm. Đến tháng 11/2017, QTD Tân Tiến vỡ nợ, gây thiệt hại gần 810 tỷ đồng.
Cáo trạng xác định, cũng trong khoảng thời gian này, QTD Thanh Bình, Thái Bình, Dầu Giây, Gia Kiệm, Quảng Tiến cũng có hàng loạt sai phạm như huy động vốn lãi suất cao, lập hồ sơ khống nhằm hợp thức hóa hồ sơ vay vốn để rút tiền của khách hàng gửi tiết kiệm, lập khống số tiền gửi, đem tiền huy động được gửi tiết kiệm tại các tổ chức tín dụng khác dưới tên các cá nhân để chiếm đoạt; để ngoài sổ sách tiền gửi, không đưa vào hạch toán... Hậu quả là đã vỡ nợ, mất khả năng chi trả hơn 500 tỷ đồng.
VKS cáo buộc, với vai trò Giám đốc NHNN Chi nhánh Đồng Nai, Tuấn đã không làm đúng công tác kiểm tra, giám sát; can thiệp kết quả thanh tra của Đoàn thanh tra, đồng thời chấp thuận dự kiến bầu Chủ tịch HĐQT QTD Thanh Bình khi chưa đủ điều kiện.
Ngoài ra, Tuấn cũng không thực hiện chỉ đạo của NHNN Việt Nam nên không kịp thời phát hiện vi phạm pháp luật của các QTD trên địa bàn Đồng Nai, dẫn đến 6 QTD bị vỡ nợ, gây thiệt hại hơn 1.352 tỷ đồng.
Đối với Khắc Hiển, VKS cho rằng, là Chánh Thanh tra Ngân hàng, Phó Giám đốc NHNN Chi nhánh Đồng Nai; được phân công trực tiếp phụ trách công tác thanh, kiểm tra, giám sát hoạt động các tổ chức tín dụng trên địa bàn tỉnh nhưng đã không thực hiện hết chức năng, nhiệm vụ. Từ đó, bị can không kịp thời phát hiện vi phạm của QTD để các đơn vị này huy động vốn với lãi suất cao, giả mạo, kê khai gian dối, lập khống hợp đồng tín dụng, làm giả hồ sơ vay vốn... gây thiệt hại số tiền lớn như trên.