Theo UBND TP Nha Trang, phạm vi nghiên cứu của đồ án có tổng diện tích khoảng 27.802ha, gồm: hơn 25.422ha diện tích TP Nha Trang hiện nay; khoảng 1.500ha diện tích bảo tồn sinh cảnh, sinh thái ngập mặn và phát triển đô thị, dịch vụ trên mặt biển; 880ha thuộc 3 xã Diên An, Diên Toàn, Suối Hiệp và thị trấn Diên Khánh của huyện Diên Khánh.
Quy hoạch chung TP Nha Trang đến năm 2040 sẽ có tính chất là đô thị du lịch biển quốc gia và quốc tế; trung tâm hành chính - chính trị - kinh tế - văn hóa - khoa học kỹ thuật của tỉnh Khánh Hòa; trung tâm kinh tế, khoa học kỹ thuật, giáo dục đào tạo và y tế của vùng Duyên hải Nam Trung bộ và Tây Nguyên; là trung tâm du lịch - thương mại - tài chính - dịch vụ hàng hải của vùng Nam Trung bộ và cả nước; có vai trò và vị trí quan trọng về an ninh - quốc phòng và bảo vệ môi trường biển.
Định hướng phát triển không gian đô thị tổng thể TP Nha Trang đến năm 2040 là nâng cao chất lượng và giá trị các không gian đô thị hiện có; phát triển mở rộng không gian xây dựng đô thị về phía Bắc, Tây Bắc, phía Tây, phía Nam và phía Đông; phát triển ra biển tại các khu vực Vĩnh Lương, Phước Đồng và trên các đảo, nhưng phải đảm bảo bảo tồn, tôn tạo và phát huy được các giá trị cảnh quan đặc trưng.
Ngoài ra, đồ án định hướng xây dựng và tổ chức hệ thống hạ tầng xanh, không gian mở làm trung tâm, tạo bản sắc và nâng cao giá trị cho không gian xây dựng; thúc đẩy, đồng thời kiểm soát các không gian phát triển đô thị và du lịch; tổ chức các khu trung tâm đô thị gắn với các không gian mở công cộng trong lòng thành phố. Các không gian mở công cộng chính là điểm nhấn cảnh quan quan trọng để phục vụ người dân thành phố và thu hút du khách…
Đồ án quy hoạch định hướng tổ chức đô thị đa trung tâm, với trung tâm chính là dải đô thị ven biển và các khu trung tâm khác tại khu vực sân bay Nha Trang cũ, dọc sông Cái, tại khu vực đô thị sinh thái Đồng Trũng phía Nam đường Phong Châu, dọc đường Võ Nguyên Giáp và các trục chính đô thị, trên đảo Hòn Tre, dọc các dòng sông khác trong thành phố và xung quanh các công viên trong mỗi khu đô thị.
Báo cáo thuyết minh của đơn vị tư vấn (Viện Quy hoạch đô thị và nông thôn quốc gia - Bộ Xây dựng) cho thấy, không gian phát triển của Nha Trang được hướng dẫn và kiểm soát phát triển theo 16 phân khu, phù hợp với đặc điểm hiện trạng và tiềm năng phát triển của từng phân khu, để mỗi khu vực có thể phát triển một cách năng động, hiệu quả và có bản sắc về kinh tế - xã hội - cảnh quan.