Theo UBKT Tỉnh ủy Kon Tum, trong giai đoạn 2009-2016, Ban Cán sự Đảng VKSND Kon Tum có khuyết điểm, vi phạm như: buông lỏng lãnh đạo, chỉ đạo, đôn đốc, kiểm tra, giám sát, để cán bộ, Đảng viên vi phạm các quy định về việc thu hồi, chi, sử dụng ngân sách, quản lý tài chính, tài sản. Vi phạm này tuy ít nghiêm trọng, nhưng đã làm ảnh hưởng xấu đến uy tín của tổ chức Đảng, gây dư luận không tốt trong cán bộ, Đảng viên.
Đối với ông Hoàng Văn Phước; nguyên tỉnh ủy viên, nguyên bí thư Ban Cán sự Đảng, nguyên viện trưởng VKSND tỉnh Kon Tum giai đoạn từ tháng 1/2009 đến tháng 9/2016 có nhiều khuyết điểm, vi phạm như: thực hiện chưa tốt trách nhiệm nêu gương của cán bộ, Đảng viên, nhất là với tư cách là người đứng đầu; vi phạm nguyên tắc tập trung dân chủ; thiếu kiểm tra, giám sát cấp dưới thực hiện nhiệm vụ được giao nên để xảy ra thiếu sót, vi phạm trong công tác quản lý, sử dụng tài chính và đầu tư xây dựng cơ bản; chỉ đạo cấp dưới thực hiện không đúng nguyên tắc tài chính kế toán và công tác quản lý, sử dụng kinh phí.
Cũng theo UBKT Tỉnh ủy Kon Tum, vi phạm của ông Phước là nghiêm trọng, gây dư luận xấu trong cán bộ, Đảng viên, làm giảm uy tín của bản thân, tổ chức Đảng và của ngành. Uỷ ban kiểm tra Tỉnh ủy đề nghị Ban Thường vụ Tỉnh ủy xem xét thi hành kỷ luật ông Phước theo quy định.
Trước đó, trong kết luận của Thanh tra VKSND Tối cao vào ngày 20/11/2018 liên quan đến những sai phạm của VKSND tỉnh Kon Tum cũng đã nêu rõ những sai phạm của ông Hoàng Văn Phước là hết sức nghiêm trọng, không chỉ gây dư luận xấu trong cán bộ, Đảng viên mà còn gây thiệt hại về tài sản của nhà nước. Bên cạnh đó, bà Nguyễn Thị Kim Thương; Kế toán trưởng kiểm Phó Chánh văn phòng VKSND tỉnh Kon Tum cũng bị đề nghị cách chức toàn bộ các chức vụ đang đảm nhiệm vì đã vi phạm mghiêm trọng các qui định của pháp luật về kế toán, tài chính. Bà Huỳnh Thị Ban, là Viện trưởng VKSND huyện Kon Rẫy giai đoạn 2012 - 2016, cũng bị đề nghị chuyển toàn bộ hồ sơ vi phạm cho cơ quan công an để tiến hành điều tra, xử lý theo qui định của pháp luật.
Kết luận của Thanh tra VKSND Tối cao cũng chỉ ra những thiếu sót trong công tác quản lý giám sát, chỉ đạo điều hành cấp dưới của ông Phan Minh Cự, Viện trưởng VKSND tỉnh Kon Tum (giai đoạn 2016 - 2020). Cụ thể, trong giai đoạn tiếp nhận nhiệm vụ thay ông Hoàng Văn Phước ông Phan Minh Cự sau khi phát hiện những dấu hiệu sai phạm đã chủ động báo cáo những sai phạm của VKSND tỉnh Kon Tum từ nhiệm kỳ trước ra VKSND Tối cao và đề nghị cho phương án xử lý. Nên trong kết luận của Thanh tra VKSND Tối cao đã nêu rõ bản thân ông Cự có khuyết điểm là; thiếu trách nhiệm trong việc kiểm tra, đôn đốc, xử lý những vi phạm tồn đọng trước đó dẫn đến việc chậm trễ trong xử lý, giải quyết những vi phạm đó.
Tập thể Ban cán sự Đảng VKSND tỉnh Kon Tum giai đoạn 2016 - 2020 cũng mắc một số khuyết điểm như; thiếu trách nhiệm trong công tác quản lý điều hành, chậm trễ trong công tác tham mưa cho Viện trưởng trong việc xử lý các sai phạm tồn tại từ giai đoạn trước…
Vì vậy, VKSND Tối cao đề nghị tập thể Ban cán sự Đảng VKSND tỉnh Kon Tum, ông Phan Minh Cự cần rút kinh nghiệm sâu sắc, tránh lặp lại những khuyết điểm trên.