Cụ thể, theo quyết định của UBND tỉnh Lạng Sơn, nếu chạy hết 64km cao tốc Bắc Giang - Lạng Sơn, tài xế xe loại 1 (xe dưới 12 ghế ngồi, xe tải dưới 2 tấn) phải nộp 134.000 đồng; tài xế xe loại 5 (xe tải từ 18 tấn tở lên, xe container 40 fit) nộp 518.000 đồng.
UBND tỉnh Lạng Sơn cũng điều chỉnh mức phí trên quốc lộ 1 đoạn từ Bắc Giang đến Lạng Sơn dài 110km, chạy song song với cao tốc. Mức thấp nhất là 52.000 đồng với xe loại 1 và cao nhất với xe loại 5 là 200.000 đồng.
Dự án cao tốc Bắc Giang - Lạng Sơn gồm 2 hợp phần: Nâng cấp mặt đường quốc lộ 1 và cao tốc chạy song song quốc lộ 1.
Sau khi hoàn thành cải tạo quốc lộ 1 vào đầu năm 2018, tuyến đường được thu phí vào giữa năm 2018 với mức thấp nhất là 35.000 đồng, cao nhất 180.000 đồng. Tuyến cao tốc được thông xe vào tháng 9/2019, miễn phí cho phương tiện lưu thông một tháng dịp Tết Canh Tý.