Các bị cáo được đưa ra xét xử trong phiên tòa gồm: Nguyễn Minh Hùng (nguyên Chủ tịch HĐQT, Tổng giám đốc Công ty Cổ phần VN Pharma); Nguyễn Trí Nhật; Ngô Anh Quốc (cùng là nguyên phó giám đốc VN Pharma). Các bị cáo đều bị truy tố về hành vi Buôn lậu và Làm giả con dấu tài liệu của cơ quan tổ chức.
Phạm Anh Kiệt (Tổng giám đốc công ty Dược Sapharco), Võ Mạnh Cường (Giám đốc công ty TNHH Thương mại hàng hải quốc tế H&C) và 4 bị cáo khác nguyên là cán bộ Công ty VN Pharma cũng bị cáo buộc cùng tội danh.
Theo kết quả điều tra: Năm 2013-2014, Nguyễn Minh Hùng đặt Võ Mạnh Cường mua thuốc tân dược của Công ty Helix Pharmaceuticals Canada sản xuất để cung cấp cho các bệnh viện ở Việt Nam. Trong đó có 9.300 hộp thuốc H - Capita 500mg Caplet để chữa bệnh ung thư.
Do không có hồ sơ kỹ thuật, tiêu chuẩn và phương pháp kiểm nghiệm thuốc để nộp cho Cục Quản lý dược (Bộ Y tế) thẩm định theo quy định, Hùng chỉ đạo nhân viên làm hồ sơ kỹ thuật thuốc H - Capita 500 mg giả. Hồ sơ gồm các giấy tờ được đóng dấu hợp pháp hóa lãnh sự của Đại sứ quán Việt Nam tại Canada… để hợp thức hóa tiêu chuẩn và chất lượng loại thuốc này.
Ngoài ra, các nhân viên của VN Pharma còn làm giả các chứng từ, thủ tục thanh toán để được Bộ Y tế cấp giấy phép nhập khẩu lô thuốc này.
Sau khi được Cục Quản lý dược đồng ý, tháng 4/2014, Công ty VN Pharma mở tờ khai hải quan nhập khẩu 9.300 hộp thuốc H - Capita 500 mg trị giá hơn 250.000 USD (khoảng hơn 5,3 tỷ đồng).
Theo kết quả đấu thầu thuốc tập trung do Sở Y tế TP.HCM công bố vào tháng 5.2014 cho thấy, giá kế hoạch mà sở mời thầu là 66 nghìn đồng/viên H-Capital 500mg Caplet nhưng thuốc của VN Pharma trúng thầu với giá chỉ có 31 nghìn đồng/viên.
Nghi ngờ nguồn gốc thuốc, Cục Quản lý dược thanh tra công ty VN Pharma, kiểm tra lô hàng. Kết quả mẫu giám định của Bộ Y tế cho thấy, lô thuốc nhập khẩu này chứa 97% hoạt chất capecitabine - là thuốc không rõ nguồn gốc, kém chất lượng, không được sử dụng làm thuốc chữa bệnh cho người.
Lô thuốc được dán tem từ Ấn Độ chuyển qua Singapore sau đó nhập khẩu về Việt Nam. Nhưng khi xác minh mã vạch lại không có thông tin bất kỳ quốc gia nào. C các giấy chứng nhận chất lượng đều là giả, cũng không có công ty nào đăng ký kinh doanh như hồ sơ VN Pharma nộp cho Cục quản lý dược.
Trước phát hiện này, Bộ Y tế đã yêu cầu Nguyễn Minh Hùng và Võ Mạnh Cường giải trình, đồng thời niêm phong không cho bán ra thị trường. Trong phần giải trình, Cường khai không biết lô thuốc được sản xuất ở đâu dù là người đặt mua.
Cơ quan điều tra cũng phát hiện Hùng còn chỉ đạo chỉnh sửa nhiều bộ hồ sơ thuốc khác, làm giả con dấu và chữ ký của giám đốc, nhân viên Công ty Helix Canada đồng ý cho VN Pharma đăng ký lưu hành thuốc. Làm giả hợp đồng mua bán một số lô thuốc với các công ty...
Cơ quan điều tra cũng đã phát hiện phó giám đốc Ngô Anh Quốc đã chỉ đạo nhân viên bán hàng chi hoa hồng cho các bác sĩ để họ kê đơn cho bệnh nhân dùng thuốc do VN Pharma cung cấp. Để bù cho khoản tiền này, Nguyễn Minh Hùng đã chỉ đạo nâng khống giá thuốc trên các hợp đồng nhập khẩu.
Trước đó, vào ngày Ngày 29.6, TAND TP.HCM đã đưa ra xét xử sơ thẩm. Tuy nhiên, ngay trong ngày xử đầu tiên, tòa quyết định hoãn phiên tòa vì xét thấy còn nhiều tình tiết chưa được làm rõ, cần bổ sung thêm chứng cứ.