Đại tá Bùi Văn Thế, Phó Giám đốc Công an TP Cần Thơ cho biết, ngày 24/12/2015, Công an TP Cần Thơ ra quyết định khởi tố vụ án hình sự số 09 để điều tra làm rõ. Ngày 16/6/2106 Cơ quan ANĐT tiến hành khởi tố bị can và bắt tạm giam 4 bị can với các tội danh trên gồm: Nguyễn Huỳnh Đạt Nhân, Phạm Tường Thi, Nguyễn Văn Đạt và Bùi Tuấn Anh.
Đối với khoản vay 258 tỷ của Công ty Tây Nam đã sử dụng không đúng mục đích theo hợp đồng vay vốn của Agribank Chi nhánh Cần Thơ mà sử dụng chính số tiền trên để mua bất động sản và sử dụng cá nhân khác nhằm chiếm đoạt tiền của Agribank Chi nhánh Cần Thơ.
Đối với khoản vay gần 200 tỷ ưu đãi hỗ trợ 100% lãi suất này, Công ty Tây Nam không thuộc đối tượng được ưu đãi lãi suất theo Quyết định số 63 ngày 15/10/2010 của Chính phủ nên đã liên quan đến nhiều đối tượng và cơ quan điều tra đang tiếp tục chứng minh vấn đề này.
Đối với hợp đồng liên doanh giữa 3 công ty để tổng thầu thi công cụm chế biến nông thủy sản Tây Nam, trên thực tế đã chứng minh chủ đầu tư là Công ty Tây Nam và đơn vị thi công là Công ty TNHH Tân Tiến chỉ là một và là do Nhân đứng ra điều hành. Riêng, công ty cung cấp thiết bị vật tư vẫn chưa ký hợp đồng cung cấp thiết bị để xây dựng cụm chế biến nông thủy sản Tây Nam mà 2 bên chỉ mới bàn bạc chưa đi đến thống nhất.
Ngoài ra, để thực hiện và che giấu hành vi lừa đảo chiếm đoạt tài sản, Nhân đã thành lập 7 công ty khác thuê người làm giám đốc và chỉ đạo cho các công ty này nâng khống tài sản thế chấp để vay tiền ngân hàng thông qua việc làm hồ sơ khống trong hoạt động kinh doanh. Nhưng thực chất các công ty trên không hoạt động kinh doanh gì mà vay tiền chuyển cho Nhân thực hiện hành vi chiếm đoạt.
Đại tá Thế cho biết thêm, trong quá trình khám xét thu giữ rất nhiều tài liệu và chứng cứ trực tiếp liên quan đến vụ án. Trong số những tang vật, đáng chú ý có áo trang phục của lực lượng an ninh nhân dân, 1 cặp tùng cấp tá và 1 cặp cầu vai cấp trung tá, 1 cành tùng cấp tướng, 1 cầu vai cấp trung tướng và một roi điện. Hiện cơ quan đang làm rõ mục sử dụng của số tang vật này.
“Trong quá trình điều tra Nguyễn Huỳnh Đạt Nhân tỏ thái độ bất hợp tác và cho mình là không có tội. Cơ quan an ninh điều tra có đủ căn cứ khởi tố và các vấn đề hết sức cân nhắc, xét đúng người, đúng tội, đúng pháp luật. Chúng tôi đã xem xét vấn đề ở nhiều khía cạnh và xét thấy vi phạm pháp luật. Nguồn tiền đang được mở rộng điều tra chứng minh” - Đại tá Thế khẳng định.
Hiện tại, Cơ quan ANĐT đã đề nghị và được VKSND TP Cần Thơ phê chuẩn gia hạn thời hạn điều tra vụ án và gia hạn tạm giam là 4 tháng đối với bị can Nguyễn Huỳnh Đạt Nhân và Phạm Tường Thi về tội danh nêu trên.