Bí thư Thành ủy Hà Nội và TP.HCM là 2 trong số 19 ủy viên Bộ Chính trị khóa 12, do Bộ Chính trị khóa 12 phân công.
Trước đó, vào tháng 10 và đầu tháng 11/2015, đại hội Đảng bộ của 2 thành phố đã không bầu chức danh Bí thư Thành ủy.
Theo quyết định của Bộ Chính trị, nguyên Bí thư Thành ủy Hà Nội Phạm Quang Nghị được phân công tiếp tục chỉ đạo Thành ủy Hà Nội và nguyên Bí thư Thành ủy TP.HCM Lê Thanh Hải chỉ đạo Thành ủy TP.HCM cho đến sau Đại hội Đảng 12.