Từ bến thuyền Tam Cốc khoảng 3km theo con đường nhỏ sẽ đến cửa hang Chùa, sau đó bạn đi bằng thuyền 40 phút trên dòng sông nhỏ là đến Thung Nham. Nằm trên diện tích 334,2ha, khu du lịch sinh thái Thung Nham đã và đang hội tụ các loại hình du lịch tổng hợp phục vụ khách như: Du lịch câu cá, leo núi, du lịch miệt vườn, du lịch tham quan rừng ngập nước, rừng nguyên sinh, các hang động nước, hang động cạn và đặc biệt là tham quan vườn chim hoang dã với đa dạng các loài chim.
Thung Nham được người dân quen gọi là thung Chim bởi nơi đây vẫn giữ được nét hoang sơ của núi rừng. Thảm thực vật phong phú, động vật hoang dã đặc biệt là các loài chim rất thích hợp với vùng đất ở đây. Cứ vào mỗi buổi chiều hoàng hôn về, từng đàn cò trắng, đại bàng đất bay về đậu kín cả một vùng đất ngập nước, du khách sẽ cảm nhận được một cảnh quan thiên nhiên kỳ thú.
Đến với khu du lịch sinh thái Thung Nham, bạn sẽ được du thuyền len lỏi trong khu rừng ngập nước, khám phá các hang động và cuộc hoang dã của các loài chim, thú, sau đó trở về nghỉ ngơi tại các nhà sàn, tận hưởng những dịch vụ chăm sóc sức khỏe và thưởng thức những món ăn ẩm thực đồng quê độc đáo nơi đây.
Với hệ sinh thái rừng ngập nước tự nhiên trên diện tích khoảng 334,2ha, trong đó có 19 ha rừng nguyên sinh, vườn chim Thung Nham là nơi cư trú của khoảng 46 loài chim, trong đó có một loài chim được ghi vào Sách Đỏ như Giang Sen, Cốc Đế nhỏ…, 109 loài thực vật thuộc 90 chi của 46 họ: 150 loài động vật, trong đó có 58 loài cá, 7 loài ếch nhái, 10 loài có vú, 8 loài bò sát và một số động vật khác cùng sống chung trong một quần thể đa dạng, thể hiện cao tính đa dạng sinh học rất cần được bảo tồn và phát triển.
Mỗi khi hoàng hôn về, từng đàn, từng đàn cò trắng bay lượn, trú ngụ kín cả một vùng đất ngập nước tạo nên khung cảnh đẹp nguyên sơ, kỳ thú khó nơi nào có được. Đây là nơi cư trú và sinh sống của đa dạng các loại chim như cò, vạc, diệp, le le, mòng két, chích chòe lửa, cho tới sáo đá… Điều đặc biệt ở vườn chim là có hai loài chim quý hiếm được ghi trong Sách đỏ là Hằng Hạc và Phượng Hoàng- một trong những linh vật nằm trong bộ tứ linh Long-Ly-Quy-Phượng.
Vườn chim Thung Nham cũng là nơi trú ngụ quan trọng của nhiều loài chim nước, điển hình là các loài cò, diệc, vạc, còng cọc, đại bàng đất và nhiều loài chim khác. Sáng sớm, từng đàn chim đi kiếm mồi ở những nơi xa xôi, tối đến lại tìm về tổ ấm. Đêm đến, những loài chim ăn đêm bắt đầu cuộc hành trình hoạt động của mình làm xao động một vùng sóng nước mênh mông.
Nếu bạn đến Thung Nham vào mùa mưa sẽ được tận mắt chứng kiến những cảnh cực kỳ sinh động khi những chú chim non sau khi được ấp nở sẽ tự vươn mình khỏi vỏ trứng để chào ánh bình minh, chim mẹ mớm mồi cho đàn con non nớt trong tiếng kêu chiêm chiếp rộn rã hay những cặp chim âu yếm nhau trong mùa sinh sản. Trải qua hàng trăm năm, đến nay qua tính toán sơ bộ, số lượng chim ở Vườn Chim có khoảng 5 ngàn tổ chim các loại.
Đến với Thung Chim, du khách sẽ được đắm mình trong sắc thái thiên nhiên hoang dã, phù hợp với tính đa dạng sinh học, phục vụ cho nghiên cứu khoa học vừa khai thác một phần thích hợp, tạo điều kiện cho khách tham quan du lịch và giải trí. Sau hành trình khám phá những vẻ đẹp hoang dã của Thung Chim, du khách có thể nghỉ ngơi trên các dãy nhà sàn ẩn mình dưới những tán rừng xanh với đầy đủ tiện nghi sinh hoạt hiện đại, tận hưởng những dịch vụ chăm sóc sức khỏe và thưởng thức những món ăn ẩm thực dân dã đồng quê độc đáo, do những nhà đầu bếp chuyên nghiệp chế biến từ những sản phẩm được thu hái từ tự nhiên của Thung Nham như lợn cắp nách, gà đồi, cá hồ tự nhiên, măng vầu, rau rừng, ... thưởng thức đặc sản mắm tép Hải Nham, nhâm nhi ly rượu nếp Khê trong, thả hồn trong không gian tĩnh mịch, thanh bình và yên ả của thung lũng Đồi Nham...
Sau phút nghỉ ngơi thư giãn, du khách có thể vui chơi giải trí tại khu vườn hoa rộng rãi thoáng mát, là nơi bạn có thể cùng mọi người chơi những trò chơi vận động như kéo co, đá bóng, cầu lông, bóng chuyền... hay cùng với gia đình, bạn bè ngồi câu cá trong các chòi câu lợp cỏ tranh xinh xắn, hoặc thong thả cùng với người thân trên tuyến đường giao thông nội bộ với chiều dài 5km rất phù hợp cho việc đi bộ tập thể dục và đi xe đạp đôi thư giãn.