Tổ công tác đặc biệt này được thành lập theo Quyết định Số 1235 /QĐ-BGTVT do Bộ trưởng Bộ GTVT Nguyễn Văn Thể ký. Tổ công tác có nhiệm vụ trực tiếp phối hợp với TP Hồ Chí Minh và các tỉnh, thành phố khu vực phía Nam, Tây Nguyên, Nam Trung Bộ và các bộ, ngành có liên quan để chủ động xử lý, giải quyết những nhiệm vụ phát sinh trong hoạt động vận tải.
Tổ công tác của Bộ GTVT cũng có nhiệm vụ trực tiếp chỉ đạo các cơ quan, đơn vị thuộc ngành GTVT để bảo đảm vận chuyển hàng hóa, nguyên liệu sản xuất, lương thực, thực phẩm, các hàng hóa thiết yếu được thông suốt giữa các tỉnh, thành phố có dịch, giữa các tỉnh, thành phố có dịch với các địa phương khác.
Theo yêu cầu của Bộ trưởng Bộ GTVT, Tổ công tác này sẽ phải hàng ngày báo cáo Bộ trưởng Bộ GTVT, báo cáo Ban Chỉ đạo quốc gia phòng, chống dịch COVID-19 và kịp thời đề xuất, kiến nghị đối với những vấn đề vượt thẩm quyền.
Kinh phí ăn, nghỉ, đi lại của các thành viên Tổ công tác được bố trí từ nguồn kinh phí của Bộ GTVT, của các cơ quan có cán bộ là thành viên Tổ công tác và nguồn kinh phí hợp pháp khác. Tổ công tác này đóng tại số 35 Hàn Thuyên, Phường Bến Nghé, Quận 1, TP Hồ Chí Minh.
Tổ trưởng Tổ Công tác đặc biệt của Bộ GTVT là ông Lê Đình Thọ - Thứ trưởng Bộ GTVT. Tổ phó gồm hai thành viên là ông Nguyễn Văn Huyện - Tổng cục trưởng Tổng cục Đường bộ Việt Nam và ông Khuất Việt Hùng - Phó Chủ tịch Chuyên trách Ủy ban ATGT Quốc gia.
Ngoài ra, Tổ có thêm 12 thành viên khác gồm: ông Trần Văn Trường - Phó Chánh Thanh tra Bộ GTVT; ông Võ Huy Cường - Phó Cục trưởng Cục Hàng không Việt Nam; ông Trần Doãn Mậu - Giám đốc Cảng vụ hàng không miền Nam, Cục Hàng không Việt Nam; ông Nguyễn Văn Thành - Cục trưởng Cục Quản lý đường bộ IV, Tổng cục Đường Bộ Việt Nam; ông Cao Xuân Giao - Cục trưởng Cục Quản lý đường bộ III, Tổng cục Đường Bộ Việt Nam; ông Phan Văn Duy - Chi cục trưởng Chi Cục Đường thủy nội địa phía Nam, Cục Đường thủy nội địa Việt Nam; ông Phạm Huy Toàn - Chi cục trưởng Chi cục Hàng hải TP. Hồ Chí Minh, Cục Hàng hải Việt Nam; ông Nguyễn Hải Nam, Giám đốc Cảng vụ Hàng hải TP. Hồ Chí Minh, Cục Hàng hải Việt Nam; ông Đỗ Hoàn Thành - Trưởng phòng Thanh tra - an toàn III, Cục Đường sắt Việt Nam; ông Phan Hữu Thế - Văn phòng Bộ GTVT phía Nam; ông Lê Văn Thanh - Chuyên viên Vụ An toàn giao thông, Bộ GTVT; ông Đỗ Quốc Phong - Chuyên viên Vụ Vận tải, Bộ GTVT.
Quyết định trên có hiệu lực kể từ ngày ký và Tổ công tác tự giải thể sau khi hoàn thành nhiệm vụ.