Theo hồ sơ vụ án, Bồ Vĩ Sâm có ký kết hợp đồng lao động với Công ty TNHH giao nhận Đế Chế (quận 1, TP HCM) và có nhiệm vụ là giao nhận hàng hóa, quản lý chứng từ hàng hóa xuất nhập khẩu. Năm 2012 và 2013 Công ty Đế Chế có ký hợp đồng mua bán với Công ty TNHH MTV Bách Mỹ Nội Y (TP Vị Thanh, tỉnh Hậu Giang) và giao cho Sâm phụ trách giao nhận hàng.
Trong quá trình làm việc, do cần tiền chi xài cá nhân, Sâm nảy sinh ý định chiếm đoạt tiền của Công ty Bách Mỹ Nội Y. Lợi dụng quá trình thực hiện các thủ tục hải quan, Sâm đã gian dối yêu cầu Công ty Bách Mỹ Nội Y phải nộp tiền tạm ứng thuế giá trị gia tăng từ 5% đến 15% trên mỗi hóa đơn nhập khẩu nguyên liệu vải từ Đài Loan sang Việt Nam, sau khi hợp đồng thanh toán xong thì sau 275 ngày Chi cục Hải quan Tây Đô sẽ hoàn trả lại số tiền tạm ứng.
Tin tưởng Sâm, từ tháng 4/2012 - 10/2014, Công ty Bách Mỹ Nội Y đã nhiều lần chuyển tiền tạm ứng thuế giá trị gia tăng cho Sâm. Từ tháng 4/2012 - 10/2014, Công ty Bách Mỹ Nội Y 61 lần chuyển tiền cho Sâm với tổng số tiền Sâm chiếm đoạt gần 1,3 tỷ đồng.
Do số tiền tạm ứng quá lớn nên Công ty Bách Mỹ Nội Y yêu cầu Sâm cung cấp biên lai thu nhận tiền tạm ứng. Để tạo niềm tin, Sâm tự ý làm giả 46 biên lai thu tiền, 02 thông báo của Cục Hải quan TP Cần Thơ với nội dung Cục Hải quan TP Cần Thơ sẽ hoàn trả số tiền tạm thu cho Công ty Bách Mỹ Nội Y sau 30 ngày kể từ ngày ra thông báo. Đến ngày 27/10/2014, Công ty Bách Mỹ Nội Y có đơn xin miễn ứng thuế nhập khẩu cho Cục Hải quan thì hành vi lừa đảo của Sâm mới bị phát hiện./.