Thanh tra tỉnh Hải Dương xác định trách nhiệm: UBND thị trấn Phú Thái chưa thực hiện đầy đủ trách nhiệm trong quản lý đất đai, không có biện pháp xử lý theo thẩm quyền đối với vi phạm về xây dựng, đê điều và sử dụng đất của ông Chúc và Xí nghiệp Thắng Lợi, cho các cá nhân, doanh nghiệp thuê đất thời điểm năm 2005, 2006 và thời gian trước khi UBND huyện Kim Thành cho ông Đặng Văn Chúc (chủ đầu tư) thuê đất tháng 10/2003 là không đúng thẩm quyền, vi phạm Luật Đất đai năm 1993 và 2003.
Phòng Tài nguyên Môi trường huyện Kim Thành thẩm định, tham mưu thu hồi đất, giao đất, ký hợp đồng thuê đất và cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất đối với dự án còn thiếu sót, chưa thực hiện đầy đủ trách nhiệm tham mưu về quản lý, hướng dẫn, kiểm tra và xử lý vi phạm đất đai.
UBND huyện Kim Thành, UBND thị trấn Phú Thái và Hạt Quản lý đê Kim Thành đã xác nhận không đúng thông tin, diện tích đất của dự án theo đơn đề nghị cho ông Chúc lập mặt bằng để trung chuyển vật liệu và sửa chữa tàu thuyền, ngoài bãi sông Kinh Môn, hồ sơ xin công bố Cảng thủy nội địa Phú Thái.
Trong công tác lãnh đạo, chỉ đạo và chấp thuận đầu tư, quản lý hoạt động xây dựng, quản lý đất đai, UBND huyện Kim Thành còn một số thiếu sót và thiếu kiên quyết trong xử lý các vi phạm về đất đai, đê điều thuộc thẩm quyền của UBND huyện, không kịp thời tham mưu, đề xuất xử lý những vướng mắc về đất đai và chấp hành chưa đầy đủ chỉ đạo của UBND tỉnh Hải Dương về giải quyết vướng mắc trong việc sử dụng đất của dự án do ông Chúc làm chủ đầu tư với diện tích 12.404m2 đất do UBND tỉnh Hải Dương cho Công ty Thế Anh thuê theo Quyết định 4778/QĐ-UBND ngày 16/12/2008.
Việc cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất số AG 371868 ngày 31/7/2006 cho Chủ đầu tư chưa đúng với vị trí, diện tích theo biên bản xác định mốc giới, diện tích ngày 2/12/2003 và Quyết định cho thuê đất số 648/QĐ-UBND ngày 15/12/2003.
Phòng Kế hoạch - Tài chính huyện Kim Thành còn thiếu sót trong thẩm định và tham mưu với UBND huyện có văn bản chấp thuận đầu tư khi chủ đầu tư là hộ kinh doanh cá thể, nhưng đăng ký sử dụng lao động từ 100 đến 150 người là chưa đúng theo quy định tại khoản 1 Điều 17 Nghị định số 02/2000/NĐ-CP ngày 3/2/2000 của Chính phủ.
Phòng Kinh tế và Hạ tầng huyện Kim Thành, Thanh tra huyện Kim Thành chưa thực hiện đầy đủ trách nhiệm tham mưu, xử lý theo chức năng, nhiệm vụ được giao…
Đối với Sở NN&PTNT tỉnh Hải Dương, Chi cục Quản lý đê điều và Phòng chống lụt bão, Thanh tra tỉnh Hải Dương xác định các đơn vị này đã có thiếu sót trong công tác thẩm định và tham mưu với UBND tỉnh Hải Dương ban hành Quyết định số 162/QĐ-UBND ngày 13/1/2004 cho phép ông Chúc lập mặt bằng để trung chuyển vật liệu và sửa chữa tàu thuyền tại bãi ngoài đê hữu sông Kinh Môn, vị trí ngoài bãi sông tương ứng Km16+150 đến Km16+450 chưa đúng họ tên người được cấp phép, không ghi thời hạn cấp phép và không đúng vị trí đất của dự án được thuê, trong đó có 3.070m2 và 12.404m2 đất của UBND thị trấn Phú Thái quản lý.
Mặt khác, Văn phòng UBND tỉnh Hải Dương khi kiểm soát các nội dung của các cơ quan chuyên môn thuộc UBND tỉnh tham mưu cấp phép và cho thuê đất tại khu vực đất bãi ngoài đê hữu sông Kinh Môn đã không phát hiện những nội dung chưa phù hợp với quy định của pháp luật trước khi trình lãnh đạo UBND tỉnh Hải Dương ký ban hành các quyết định; chưa chủ động tham mưu với UBND tỉnh chỉ đạo các cơ quan chức năng kiểm tra, xem xét giải quyết vướng mắc về đất đai giữa dự án do ông Chúc làm chủ đầu tư và Dự án của Công ty Thế Anh đã được UBND tỉnh Hải Dương cho thuê đất từ năm 2008 đến nay.