Khó khăn hiện nay nằm ở khâu đánh giá, định giá tài sản giá trị quyền sử dụng đất, lợi thế quyền thuê đất, dự án hình thành trong tương lai gắn liền với đất thuê. Điều này dẫn đến phát sinh nhiều phức tạp liên quan chủ yếu đến sắp xếp, xử lý cơ sở nhà, đất đối với tài sản công, xác định phương án sử dụng đất cũng như giá đất.
Hiện VICEM đang có 3 lô đất khó xử lí trong quá trình CPH là lô 10E6 Phạm Hùng, thuộc dự án trung tâm điều hành và giao dịch VICEM (Hà Nội); dự án Khu tổng hợp Vĩnh Tuy tại ngõ 122 Vĩnh Tuy (Hà Nội); dự án nhà máy kết cấu bê tông vật liệu xây dựng không nung Đông Hồi thuộc Khu công nghiệp Đông Hồi (Nghệ An).
Tại báo cáo gửi Thủ tướng Chính phủ mới đây, Bộ Xây dựng đề cập cụ thể về các phương án sắp xếp lại, xử lý nhà đất do VICEM đề xuất. Theo đó, đối với lô đất 10E6 Phạm Hùng, VICEM muốn bán tài sản trên đất, chuyển nhượng quyền sử dụng đất. Dự án khu tổng hợp Vĩnh Tuy tại ngõ 122 Vĩnh Tuy, VICEM muốn tiếp tục được quản lý, sử dụng. Dự án tại Đông Hồi (Nghệ An), VICEM muốn chuyển nhượng dự án cho VICEM Hoàng Mai. Các đề xuất của VICEM được Bộ Xây dựng thống nhất về cơ bản và đã có văn bản đề nghị Bộ Tài chính xem xét, cho ý kiến đối với phương án xử lý, sắp xếp lại nhà đất tại khu đất này.
Theo Bộ Xây dựng, nếu phương án sắp xếp điều chỉnh đối với 2 cơ sở nhà đất ở Phạm Hùng và Đông Hồi được cơ quan Nhà nước có thẩm quyền phê duyệt với hình thức bán tài sản, chuyển nhượng quyền sử dụng đất, chuyển nhượng dự án như đề xuất thì VICEM phải có trách nhiệm triển khai thực hiện theo đúng phương án được duyệt, tuân thủ các quy định pháp luật, đảm bảo chặt chẽ, công khai, minh bạch, không làm thất thoát vốn, tài sản nhà nước.