Theo KLTT, Ban Quản lý Khu kinh tế tỉnh Kon Tum và các đơn vị trực thuộc bên cạnh những ưu điểm trong việc chấp hành các quy định của pháp luật về quản lý và sử dụng các nguồn kinh phí; quản lý, sử dụng tài sản công và thực hiện chính sách, pháp luật về đầu tư xây dựng thì còn tồn tại những khuyết điểm, hạn chế.
Cụ thể, trong việc chấp hành các quy định của pháp luật về quản lý và sử dụng các nguồn kinh phí, tại Văn phòng Ban Quản lý Khu kinh tế tỉnh Kon Tum, một số chứng từ mua vật tư, văn phòng phẩm thiếu danh sách cấp phát cho người sử dụng và giấy đề nghị thanh toán.
Về kinh phí đặt hàng sự nghiệp công, đơn giá và khối lượng công việc giữa quyết định đặt hàng, hợp đồng kinh tế có sự chênh lệch so với các phụ lục hợp đồng, biên bản nghiệm thu thanh lý hợp đồng.
Cùng với đó, việc phê duyệt dự toán khối lượng đặt hàng, nghiệm thu khối lượng đặt hàng năm 2022 một số hạng mục không sát khối lượng theo biên bản xác định nhiệm vụ, khối lượng ngày 19/6/2020 (biên bản kèm theo Quyết định số 834/QĐ-UBND ngày 27/8/2020). Nghiệm thu, thanh toán thừa số lượng cây hạng mục duy trì cây cảnh tạo hình tại đường trục chính khu 1.
Tại Công ty Đầu tư phát triển hạ tầng Khu kinh tế, nguồn thu đặt hàng cung cấp dịch vụ sự nghiệp công: Nghiệm thu, đề nghị thanh toán thừa số lượng cây hạng mục duy trì cây cảnh tạo hình tại đường trục chính khu 1.
Đối với Ban Quản lý Cửa khẩu Quốc tế Bờ Y, một số chứng từ mua văn phòng phẩm, công cụ, dụng cụ chưa bảo đảm theo quy định; vật tư, hàng hóa không thể hiện chi tiết quy cách, xuất xứ của sản phẩm, chưa bảo đảm các quy định hướng dẫn công khai về thông tin sản phẩm tiêu thụ; hồ sơ thanh toán sửa chữa máy phát điện, gia công lắp đặt trụ cờ chưa thực hiện đúng quy trình, quy định của Luật Đấu thầu số 43/2013/QH13 và Nghị định số 63/2014/NĐ-CP của Chính phủ.
Trong việc thực hiện chính sách, pháp luật về đầu tư xây dựng, KLTT chỉ ra rằng, quá trình nghiệm thu thanh toán còn sai với khối lượng thực tế thi công, chủ đầu tư chưa rà soát, cắt giảm phần dự toán tính thừa khối lượng so với hồ thiết kế bản vẽ thi công, dẫn đến thanh toán sai khối lượng so với hồ sơ thiết kế, hồ sơ hoàn công.
Trước những tồn tại, hạn chế trên, Thanh tra tỉnh Kon Tum đề nghị Trưởng Ban Quản lý Khu kinh tế tỉnh (hoặc Phó Trưởng ban phụ trách điều hành chung) có trách nhiệm thu hồi số tiền hơn 44 triệu đồng nộp vào ngân sách nhà nước. Đồng thời, chỉ đạo các đơn vị được thanh tra khắc phục những khuyết điểm, tồn tại; phối hợp với Trung tâm Môi trường và Dịch vụ đô thị huyện Ngọc Hồi có phương án thu phí vệ sinh môi trường trên một số tuyến đường có các hộ sinh sống, kinh doanh mà chưa thực hiện đóng phí vệ sinh môi trường nhằm giảm phần hỗ trợ từ ngân sách nhà nước đối với khối lượng đặt hàng; chỉ đạo Ban Quản lý Cửa khẩu Quốc tế Bờ Y tiếp tục xây dựng phương án đấu giá tài sản đối với các vị trí còn lại nhằm bảo đảm chi phí hoạt động của đơn vị và khai thác, sử dụng có hiệu quả tài sản cho thuê theo đề án đã được UBND tỉnh phê duyệt.