Mục tiêu tổng quát của chương trình là xây dựng thế hệ thanh niên tỉnh Phú Yên phát triển toàn diện, giàu lòng yêu nước, có ý chí tự lực, tự cường, tự hào dân tộc; có lý tưởng cách mạng, hoài bão, khát vọng vươn lên xây dựng đất nước; có đạo đức, ý thức công dân, chấp hành pháp luật; có sức khỏe và lối sống lành mạnh; có văn hóa, kiến thức, trình độ học vấn, kỹ năng sống, nghề nghiệp và việc làm; có ý chí lập thân, lập nghiệp, năng động, sáng tạo, làm chủ khoa học, công nghệ.
Phát triển nguồn nhân lực trẻ chất lượng cao, đáp ứng yêu cầu phát triển nhanh và bền vững của tỉnh, góp phần phát triển đất nước, hội nhập quốc tế. Phát huy tinh thần cống hiến, xung kích, tình nguyện và nâng cao trách nhiệm của thanh niên trong sự nghiệp xây dựng, bảo vệ Tổ quốc.
Chương trình hướng tới 6 nhóm mục tiêu cụ thể để thực hiện đạt các chỉ tiêu đề ra. Trong đó, nhóm mục tiêu về phát huy vai trò của thanh niên trong tham gia phát triển kinh tế - xã hội và bảo vệ Tổ quốc, phấn đấu hằng năm, 100% thanh niên trong độ tuổi quy định của pháp luật có đủ năng lực hành vi dân sự sẵn sàng tham gia thực hiện nghĩa vụ quân sự và lực lượng dân quân tự vệ, dự bị động viên. Thanh niên là học sinh, sinh viên được giáo dục quốc phòng, an ninh để nâng cao lòng tự hào, tự tôn dân tộc theo Luật Giáo dục Quốc phòng, an ninh năm 2014.
Đến năm 2030, phấn đấu 20% thanh niên trong các cơ quan Nhà nước, tổ chức chính trị - xã hội được đưa vào quy hoạch lãnh đạo cấp sở, phòng và tương đương; phấn đấu 15% thanh niên trong các cơ quan Nhà nước, tổ chức chính trị - xã hội đảm nhiệm các chức vụ lãnh đạo, quản lý.
Hằng năm, 100% tổ chức Đoàn thanh niên tại các khu công nghiệp được thành lập theo quy định của pháp luật; phát động phong trào và huy động thanh niên hưởng ứng, tham gia các hoạt động tình nguyện vì cộng đồng, xã hội; phát triển kinh tế - xã hội; khắc phục hậu quả thiên tai, dịch bệnh; bảo vệ môi trường; giữ gìn trật tự, an toàn xã hội, quốc phòng, an ninh quốc gia.
Nhiệm vụ, giải pháp của chương trình tập trung tăng cường sự lãnh đạo, chỉ đạo của cấp ủy, chính quyền các cấp; phát huy vai trò của Mặt trận Tổ quốc Việt Nam, Đoàn Thanh niên Cộng sản Hồ Chí Minh, các tổ chức đoàn thể và thanh niên; đẩy mạnh công tác tuyên truyền, phổ biến chính sách, pháp luật; cung cấp thông tin về tư vấn, hỗ trợ pháp lý cho thanh niên; cụ thể hóa, triển khai thực hiện chính sách, pháp luật về thanh niên. Ngoài ra, tăng cường cung cấp dịch vụ, hoạt động hỗ trợ thanh niên; bảo đảm nguồn lực để tổ chức thực hiện chương trình phát triển thanh niên.