Đồng thời, tỉnh cũng xin phép được điều chỉnh quy hoạch chung xây Khu kinh tế Vân Phong đến năm 2030, theo hướng hiện đại, đáp ứng nhu cầu phát triển của Khu kinh tế Vân Phong, nhằm tạo điều kiện cho việc kêu gọi đầu tư.
Khánh Hòa đã thực hiện một số thủ tục lập quy hoạch tổng thể phát triển kinh tế - xã hội đặc khu Bắc Vân Phong, nhưng đến nay Luật Đặc khu chưa được thông qua. Do vậy, việc quy hoạch của tỉnh gặp vướng mắc khi chưa xác định được cơ sở pháp lý, trình tự thủ tục, nội dung quy hoạch, hội đồng thẩm định và các nội dung liên quan.
Theo báo cáo, tại khu vực Nam Vân Phong (thị xã Ninh Hòa), việc triển khai dự án theo điều chỉnh quy hoạch chung của Khu kinh tế Vân Phong đến năm 2030 tiếp tục thực hiện. Tại đây, nhiều dự án đi vào hoạt động và đang được xây dựng, như nhà máy tàu biển Hyundai Vinashin với vốn 375 triệu USD; cảng tổng hợp Vân Phong (985 tỷ đồng), kho xăng dầu Vân Phong (125 triệu USD)...
Đặc khu kinh tế là định hướng của Bộ Chính trị, dự kiến triển khai tại Vân Phong, Vân Đồn (Quảng Ninh) và Phú Quốc (Kiên Giang). Dự án Luật Đơn vị hành chính kinh tế đặc biệt cho ba nơi trên được Chính phủ trình Quốc hội cho ý kiến tại Kỳ họp thứ 4 (tháng 10/2017), sau đó được tiếp thu, chỉnh lý. Tháng 6/2018, Quốc hội biểu quyết đồng ý lùi dự án luật này với hơn 85% đại biểu tán thành.
